Todos voltam para Roswell, mas nem tudo está bem. Jesse está tendo dificuldades em lidar com a identidade alien de Isabel. Ele começa a ver um terapeuta e decide que precisa ficar um tempo longe dela. Max e Liz voltam a namorar e Max diz que não quer mais as responsabilidades alienígenas que o esperam, ele só quer ficar com Liz. Enquanto isso, como resultado da morte de Max, Michael foi programado para ser o líder do trio e começa a tentar controlar todos, inclusive Max. Quando ele descobre que Jesse está indo ao terapeuta, ele decide acabar com o problema sozinho e tenta matar Jesse, o que causará uma grande briga pois Max está tentando salvar a todos.